Table 3. Primer sequences and PCR conditions for detection of antibiotic resistance genes in L. plantarum KU15149 (KU15149) and L. brevis KU15176 (KU15176)

Antibiotics Target gene Primer sequence (5’→3’) Tm (°C) Size (bp) KU15149 KU15176
Ampicillin blaZ ACTTCAACACCTGCTGCTTTCTAGGTTCAGATTGGCCCTTAG 50 240 1)– –
bla CATARTTCCGATAATASMGCCCGTSTTTAACTAAGTATSGY 51 297 – –
Chloram-phenicol catA GGATATGAAATTTATCCCTCCAATCATCTACCCTATGAAT 50 486 – –
cat TTAGGTTATTGGGATAAGTTAGCATGRTAACCATCACAWAC 48 300 – –
Clindamycin Inu(A) GGTGGCTGGGGGGTAGATGTATTAACTGGGCTTCTTTTGAAATACATGGTATTTTTCGATC 55 323 – –
Inu(B) CCTACCTATTGTTTGTGGAAATAACGTTACTCTCCTATTTC 54 925 – –
Erythromycin ereA AACACCCTGAACCCAAGGGACGCTTCACATCCGGATTCGCTCGA 50 420 – –
ereB AGAAATGGAGGTTCATACTTACCACATATAATCATCACCAATGGCA 50 546 – –
Erm(B) GAAAAGGTACTCAACCAAATAAGTAACGGTACTTAAATTGTTTAC 52 639 – –
Erm(B)-1 CATTTAACGACGAAACTGGCGGAACATCTGTGGTATGGCG 52 405 – –
Erm(C) TCAAAACATAATATAGATAAAGCTAATATTGTTTAAATCGTCAAT 52 642 – –
Gentamycin aac(6’)-aph(2’’) CCAAGAGCAATAAGGGCATACACTATCATAACCACTACCG 60 220 – –
aac(6’)-aph(2’’La CAGAGCCTTGGGAAGATGAAGCCTCGTGTAATTCATGTTCTGGC 58 348 – –
Kanamycin aph(3’)-I AACGTCTTGCTCGAGGCCGCGGGCAAGATCCTGGTATCGGTCTGCG 68 670 – –
aph(3’)-III GCCGATGTGGATTGCGAAAAGCTTGATCCCCAGTAAGTCA 60 292 – –
Streptomycin aadA ATCCTTCGGCGCGATTTTGGCAGCGCAATGACATTCTTG 56 282 – –
aadE ATGGAATTATTCCCACCTGATCAAAACCCCTATTAAAGCC 50 565 – –
ant(6) ACTGGCTTAATCAATTTGGGGCCTTTCCGCCACCTCACCG 53 597 – –
Tetracycline tet(M) GGTGAACATCATAGACACGCCTTGTTCGAGTTCCAATGC 52 401 – –
tet(M)-1 GTTAAATAGTGTTCTTGGAGCTAAGATATGGCTCTAACAA 55 576 – –
tet(K) TCGATAGGAACAGCAGTACAGCAGATCCTACTCCTT 55 348 – –
tet(K)-1 TTAGGTGAAGGGTTAGGTCCGCAAACTCATTCCAGAAGCA 55 697 – –
tet(K)-2 TTATGGTGGTTGTAGCTAGAAAAAAGGGTTAGAAACTCTTGAAA 55 348 – –
tet(Q) AGCGTCAAAGGGGAATCACTATCCCGGCGGGGTTGGCAAATA 55 1,000 – –
Vancomycin vanE TGTGGTATCGGAGCTGCAGGTCGATTCTCGCTAATCC 52 513 – –
vanX TCGCGGTAGTCCCACCATTCGTTAAATCATCGTTGACCTGCGTTAT 55 454 2)+ –
not detected.
detected.